在五水硼砂中，水分子中的氧原子具有较强的电负性，使得与之相连的氢原子带部分正电，这种部分正电的氢原子可以与硼酸盐结构中的氧原子产生相互作用，形成氢键。由于氧原子的电子层结构，每个水分子中的氧原子还能与相邻的两个氢原子产生相互作用，从而形成了高密度的氢键网络。
该产品的氢键形成是一个复杂的过程，涉及水分子与硼酸盐结构中的氧原子之间的相互作用。这种相互作用基于氢原子的电负性和五水硼砂原子的接近性，以及水分子中氧原子的强电负性。形成的氢键不仅维持了五水硼砂的晶体结构，还影响了其物理性质，如熔点和沸点等。
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